第一代无创产前诊断是通过染色体倍数异常来判断的，最典型的就是先抽取孕妇的外周血，提取游离DNA，通过高通量测序技术分析每染色体片段，判断胎儿是否是21号三倍体。第二代无创产前诊断分析的是基因突变诊断。
最新这篇文章通过针对母体血浆DNA进行全基因组测序（195×和270×单倍体基因组覆盖），探索无创性产前检测的限制范围。研究人员结合一系列生物信息学筛选，完成了高于之前报道两个数量级的阳性预测值检测胎儿新发突变。
并且研究人员在一个CFC综合征案例中无创发现了一个新发BRAF突变，CFC综合症主要出现在心脏方面，包括肺动脉狭窄、瓣膜发育不良等，通常病患没有眉毛和眼睫毛，其指甲呈现发育不良或生长过快，这一综合征的致病基因属于RAS-ERK讯息传递路径中的成员。
研究人员指出胎儿母系遗传可以通过全基因组分析确定，而无需母体单倍体信息，从而极大的增加了此类分析的分辨率。这些研究表明血浆DNA 片段末端（胎儿或母体筛选）的某些基因组位点可能存在重复报道。
设想母亲在某个基因的某个位置上的核苷酸是Aa, 如果胎儿的是致病的aa型。那么，考虑到胎儿的DNA在孕妇的血液中只占5%. 通过对孕妇的外周血的超高通量测序(1000倍覆盖)，如果测出来A占了42.5%, a占了47.5%，我们就可断定胎儿的基因型是aa. 这里的关键是测序深度要非常高，1000X。
Second generation noninvasive fetal genomeanalysis reveals de novo mutations, single-base parental inheritance, andpreferred DNA ends.
----------------上述内容摘自测序中国。
如果技术上能进一步突变，那无创产筛会得到质的飞跃。